第一季的主题曲由著名歌手平野绫演唱，歌名为《only my railgun》，这是一首节奏感强烈的摇滚风格歌曲，完美契合了炮姐（御坂美琴）活泼开朗又不失正义感的形象。而第二季则采用了另一位实力派歌手水树奈奈带来的《LEVEL5 -judgelight-》，这首歌曲在旋律上更加成熟大气，与故事发展到新阶段时角色们的成长轨迹相呼应。
无论是哪一首歌，它们都成功地将《某科学的超电磁炮》中所传达出的那种积极向上的精神通过音符传递给了每一位听众。这也使得这两首主题曲成为了动漫与音乐结合的最佳典范之一。如果你还没有听过这些歌曲的话，不妨找来听听看，相信你会被它们深深吸引！
